儿童教育研究院是基于学校“服务0-12岁儿童成长”办学定位，整合市、校两级儿童领域科研平台的基础上组建。2018 年与教育部学校规划建设发展中心正式挂牌共建全国首家儿童研究院。2019 年，儿童研究院设置为独立科研机构。2021年，儿童研究院更名为儿童教育研究院。目前，儿童教育研究院设院长1名，下设综合科和儿童发展研究中心2个科室，围绕儿童启蒙师资创新培养研究、儿童家庭启蒙教育发展研究、儿童营养与健康教育研究等3个重点方向建有16个研究所、30个特色工作室。

儿童教育研究院整合优质资源，打造核心团队。现有专兼职研究人员42人，其中，教授占36.58%，副教授占63.42%，博士占41.46%。专兼职研究员中有国家百千万人才工程入选者、重庆市创新领军人才、巴渝学者、巴渝学者（青年学者），同时聘有一批基础教育领域行业专家，形成一支多学科交叉、老中青交融、跨领域协同的创新团队。

儿童教育研究院聚焦成果产出，服务地方决策。研究团队坚持聚焦儿童，立足区域服务，已在小学全科教师培养、幼儿课程资源开发、农村留守儿童教育、幼儿家庭教育、儿童益生菌研发、智能化青少年体质测试等领域形成研究特色，发布专项课题140项，成果获授权专利119项，出版著作36部，发表论文100余篇，出版绘本、读本15册，开发早教课程4套，产出《农村留守儿童寄宿教育研究》、《小学全科教师人才培养研究》、《未来幼儿园教师工作标准研究》、《未来托幼机构科学保教规范管理指南》、“儿童研学实践系列团体标准”及发明专利“玩具用儿童安全帽及其玩耍平台”“一种游戏处理方法及装置”等一批代表性成果。主编《3-6岁重庆市家庭教育指导读本》被重庆市妇联作为公益家庭教育指导书在全市推广，10余篇资政报告获市领导肯定性批示和多部门采纳应用，为重庆市儿童教育高质量发展贡献了智慧。

儿童教育研究院得到了社会的广泛关注。教育部学校规划建设发展中心在官微“教育之弦”以《让未来走向孩子，这个儿童研究院成绩斐然》为主题连续 4 期进行报道；《光明日报》、《中国教育报》、《重庆日报》、《华龙网》等媒体也进行了多次报道，2019年获献礼新中国成立70周年年度最具影响力智库奖。未来，儿童教育研究院将紧密对接重庆区域基础教育和儿童行业领域，加强应用研发和资政服务，开发特色教育资源，构建儿童发展领域跨学科的师生创新共同体，力争建成特色鲜明、区域一流的人文社会科学研究基地。